由于出质人经营不善，质押贷款到期未按照协议的约定还款，质权人委托相应的机构对质物进行拍卖，拍卖所得超出了债务价值，超出部分质权人支付了监管人的监管费后，将剩余部分自己留存。按照《物权法》的规定，这种做法是允许的。