必须招投标的工程项目，经过备案的施工合同中专用条款关于进度款支付的约定是“见补充合同”，但补充合同没有备案。请问：专用条款中的这种关于“进度款支付”的约定有效吗？如果认定有效，那么如何认定未备案的“补充合同”的效力？