某工程未进行招投标，甲乙双方签订建设工程施工合同，后因办理竣工备案手续的需要，双方补办了招投标手续，并且根据投标文件及中标通知书的规定，签订了一份建设工程施工合同，条款与前一份建设工程施工合同有不同。请问：进入诉讼程序后，哪份建设工程施工合同有效？